Laboratorio Infolife

Partecipano al laboratorio 35 gruppi di ricerca, che fanno capo ad altrettante Unità di Ricerca di Atenei, per un numero complessivo di ricercatori strutturati superiore a 200, cui si aggiunge un’analoga quantità di personale non strutturato.

Ogni gruppo di ricerca costituisce un “Nodo” del Laboratorio. L’elenco qua sotto li elenca in ordine alfabetico, con il nominativo del referente del Nodo, l'indicazione schematica di aree di interesse classificate rispetto alle dimensionimetodologiche  ed applicative e le risorse web dove reperire ulteriori informazioni sul nodo e le sue competenze/interessi.

Ateneo

Referenti ed espressioni chiave

Web resources

Bari 

Donato Malerba

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Individuazione di correlazioni tra entità biologiche per lo studio di ncRNA  Data-Mining  Sequenze
Reti
Modelli predittivi per l'individuazione della funzione dei geni  Data-Mining  Predizione
Reti 
Tecniche di data mining descrittivo per la caratterizzazione di entità biomediche  Data-Mining  Reti 
 

Benevento Sannio

Michele Ceccarelli

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Modellazione e inferenza di reti di regolazione genica e System Biology Sistemi  Reti
Algoritmi per la Biologia Computazionale Algoritmi Dati-Clinici
Reti 
Analisi integrativa di Dati Molecolari Data-Mining  Dati-Clinici
 

Bologna

Piero Fariselli

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Algoritmi per lo studio di biomolecole e delle loro interazioni Algoritmi
Data-Mining
Sequenze
Predizione
Reti
Calcolo parallelo e sistemi intelligenti di gestione di dati BioMedici Data-Mining
Infrastrutture
Sequenze
Dati-Clinici
Modellazione di sistemi biologici e simulazioni con tecniche "Bio-inspired" Formalismi
Sistemi
Popolazioni
Reti
 

Cagliari

Nicoletta Dessì

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Apprendimento Automatico e Data Mining per l’Analisi di Geni e Proteine Algoritmi
Data-Mining
Sequenze
Dati-Clinici
Elaborazione di immagini e segnali biomedici Algoritmi/Data-Mining Dati-Clinici
Reti 
Sviluppo di ambienti e infrastrutture per la Bioinformatica Infrastrutture Infrastrutture
 

Cassino

Francesco Tortorella

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Algoritmi di apprendimento ROC-based per classificatori binari Sistemi  Reti
Sistemi di classificazione multi-esperto e semi-supervised Algoritmi
Data-Mining
Dati-Clinici
Algoritmi di detection di oggetti su immagini Algoritmi
Data-Mining
Dati-Clinici
 

Catania

Alfredo Ferro

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Analisi di Reti Biologiche Algoritmi Reti
Analisi di RNA non codificanti e regolatori Data-Mining Sequenze
Biologia dei Sistemi e Biologia Sintetica Sistemi Predizione
 

Catanzaro Magna Grecia

Mario Cannataro

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Calcolo parallelo e distribuito per preprocessing ed analisi di dati genomici e proteomici Algoritm
Data-Mining
Predizione
Dati-Clinici
Rappresentazione analisi e visualizzazione efficiente di reti di interazione proteica e pathways Algoritmi
Infrastrutture
Reti
Gestione, interrogazione ed analisi di dati clinici, sanitari e biosegnali ed applicazioni in ambito clinico e sanitario Infrastrutture Dati-Clinici
 

Chieti-Pescara

Fabio Fioravanti

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Modellazione di sistemi biologici tramite Statecharts Formalismi
Infrastrutture
Reti
     
     
 

Ferrara

Evelina Lamma

 
Interessi Metodologie Applicazioni
     
     
     
 

Firenze

Paolo Frasconi

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Protein structure prediction Data-Mining Predizione
Prediction of disulfide bridges Data-Mining
Infrastrutture
Predizione
Prediction of protein metal binding Data-Mining
Infrastrutture
Predizione
 

Foggia

Crescenzio Gallo

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Analisi di correlazione di dataset ambientali e biologici Algoritmi
Data-Mining
Reti
Dati-Clinici
Analisi di caratteristiche ed alterazioni morfoligichee meccaniche cellulari Sistemi Popolazioni
     
 

Genova

Francesco Masulli

 

 

 

Interessi Metodologie Applicazioni
Apprendimento Automatico e Intelligenza Computazionale Algoritmi
Data-Mining
Reti
Dati-Clinici
Elaborazione ed analisi di grandi moli di dati eterogenei Data-Mining
Infrastrutture
Dati-Clinici
Metodi e linguaggi formali Formalismi Popolazioni
Reti
 

L'Aquila

Antinisca Di Marco

 
Interessi Metodologie Applicazioni

Ambienti e infrastrutture per la bioinformatica; Integrazione e analisi

di dati biomedici-molecolari; Applicazioni cliniche dell'ICT

Infrastrutture
Sistemi
Data-Mining
Predizioni
Sequenze
Dati-Clinici
Next-generation sequencing, gene expression analysis e analisi
dei microRNA
Data-Mining
Algoritmi
Sequenze
Dati-Clinici
Metodi matematici di ottimizzazione, metodi statistici, metodi formali
e algoritmi per l'analisi di dati molecolari
Formalismi
Algoritmi
Machine Learning
Network Analysis
Sequenze
Predizioni
Reti
 

Milano

Giorgio Valentini

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Machine Learning per l'analisi di dati biomolecolari complessi Data-Mining  Predizione
Reti
Elaborazioni di segnali ed immagini in medicina Algoritmi Dati-Clinici
Modelli matematici di strutture biologiche e sistemi ibridi bio-elettronici Sistemi Dati-Clinici
 

Milano Bicocca

Giancarlo Mauri

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Simulazione multiscala di sistemi biologici complessi Algoritmi
Infrastrutture
Reti
Analisi di sequenze, in particolare dati NGS Algoritmi Sequenze
Analisi di dati biomedici Algoritmi
Data-Mining
Dati-Clinici
 

Milano Politecnico

Marco Masseroli

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Astrazione di modelli per gestione, interrogazione e analisi dati genomici. Formalismi
Infrastrutture
Reti
Dati-Clinici
Metodi e algoritmi d’integrazione e analisi d’informazioni ontologiche e dati biomedici-molecolari Algoritmi
Infrastrutture
Predizione
Tecniche di apprendimento automatico e datamining per l'analisi di dati biomedici-molecolari Formalismi
Data-Mining
Reti
Dati-Clinici
 

Modena e Reggio Emilia

Marco Villani

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Protocellule ed origine della vita Sistemi Popolazioni
Reti
Differenziamento cellulare Formalismi
Sistemi
Reti
Interpretazione di dati biologici e medici Formalisimi
Sistemi
Reti
Dati-Clinici
 

Napoli Parthenope

Alfredo Petrosino

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Sviluppo ed applicazione di metodi di machine learning e statistici per l'analisi di espressioni geniche Algoritmi
Data-Mining
Sequenze
Predizione
Dati-Clinici
Approcci supervisionati e non supervisionati per la classificazione della struttura 3D delle proteine Algoritmi
Data-Mining
Predizione
Machine learning e web application per facilitare e rendere efficace l'analisi nei complessi sistemi biologici e alternative splicing prediction Algoritmi
Data-Mining
Sequenze
Predizione
 

Padova

Matteo Comnin

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Efficient algorithms for the analysis of biological sequences and networks Algoritmi
Data-Mining
Sequenze
Reti
Biomarker discovery and modeling of biological systems from genomic data Sistemi Predizione
Reti
 

Palermo

Raffaele Giancarlo

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Algoritmi e metodologie per compressione, archiviazione ed analisi di grosse quantità di sequenze biologiche generate da tecnologie HTS Algoritmi Sequenze
Metodologie di data mining, pattern discovery e inferenze in dati genomici Algoritmi
Data-Mining
Sequenze
Dati-Clinici
Metodologie algoritmiche e statistiche per confronto ed analisi di reti biologiche Algoritmi
Data-Mining
Reti
Dati-Clinici
 

Parma

Dal Palù Alessandro

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Predizione struttura proteine Algoritmi Predizione
Analisi di espressione genica mediante immagini biomediche Data-Mining Dati-Clinici
Studio spazio conformazionale e scoring energetico di peptidi Algoritmi Predizione
 

Pavia

Virginio Cantoni

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Retrieval e identificazione di motivi su PDB sulla base delle strutture secondarie Algoritmi Predizione
Strutture dati per la ricerca e l'analisi di pocket per il docking di proteine-proteine e protenie-ligando Formalismi Reti
Metodi computazionali per l'analisi massiva di strutture molecolari 3D Algoritmi Predizione
 

Piemonte Orientale

Giovanni Manzini

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Algorithms and data structures for pattern matching in biosequences Algoritmi Sequenze
Calculi and type systems for modelling biological systems Formalismi Predizione
     
 

Pisa

Paolo Milazzo

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Infrastrutture di supporto alle indagini bioinformatiche Infrastrutture Sequenze
Predizione
Analisi di dati genomici Algoritmi Sequenze
Formalismi e modelli per sistemi biologici Formalismi
Sistemi
Popolazioni
Reti
 

Rende Calabria

Luigi Palopoli

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Biological network analysis Algoritmi Reti
Noisy-pattern discovery Algoritmi Sequenze
Surprising patterns analysis and detection Data-Mining  Sequenze
Reti
 

Roma Sapienza

Alberto Marchetti Spaccamela

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Reti metaboliche, simbiosi Sistemi  Reti
Biobanking and biomolecular resources infrastructure Infrastrutture Dati-Clinici
     
 

Roma Tor Vergata

Enrico Nardelli

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Modelli di sistemi biologici basati su StateCharts Formalismi
Infrastrutture
Reti
     
     
 

Salerno

Roberto Tagliaferri

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Neuroinformatica ed integrazione di dati biomedici multi-dominio e multi-vista Data-Mining Dati-Clinici
Modelli di computazione ispirati da meccanismi biologici Formalismi Sequenze
Rappresentazione, memorizzazione e analisi di dataset biologici: algoritmi e metodologie combinatoriali Algoritmi Sequenze
Predizione
 

Siena

Moreno Falaschi

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Modeling and identification of complex processes in immune and biochemical systems Formalismi
Sistemi
Popolazioni
Reti
Dati-Clinici
Predizione di hotspot superficiali transienti in proteine Algoritmi
Infrastrutture
Predizione
Dati-Clinici
Piattaforme di calcolo ad alte prestazioni Algoritmi
Infrastrutture
Predizione
Reti
Dati-Clinici
 

Torino

Francesca Cordero

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Sviluppo di nuovi algoritmi e work-flow per analisi di dati derivati da tecnologie high-throughput Algoritmi
Infrastrutture
Sequenze
Reti
Modellazione di sistemi biologici Formalismi Popolazioni
Reti
Approcci di machine learning in ambito biologico Data-Mining  Sequenze
Reti
 

Torino Politecnico

Alfredo Benso

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Network Biology: modellazione e simulazione di reti biologiche complesse Sistemi Predizione
Reti
Metodi computazionali per l'analisi di dati da sequenziamento massivo parallelo e da imaging ad alta risoluzione Algoritmi
Infrastrutture
Sequenze
Dati-Clinici
     
 

Trento

Enrico Blanzieri

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Apprendimento automatico Data-Mining Sequenze
Predizione
Reti
Bioinformatica strutturale Data-Mining
Infrastrutture
Sequenze
Predizione
Analisi di espressione genica Algoritmi
Data-Mining
Predizione
Reti
 

Udine

Alberto Policriti

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Algorithms and data structures for bioinformatics Algoritmi
Infrastrutture
Sequenze
Systems Biology Formalismi
Sistemi
Reti
Dati-Clinici
Predizione di strutture proteiche Formalismi
Infrastrutture
Predizione
Reti
 

Urbino

Alessandro Bogliolo

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Accelerazione di algoritmi di pattern matching tramite tecniche di compressione Algoritmi Sequenze
Analisi di sequenza di DNA Algoritmi Sequenze
Analisi di reti biologiche mediante algoritmi di teoria dei grafi Algoritmi Reti
 

Venezia Ca' Foscari

Nicoletta Cocco

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Systems Biology Formalismi Reti
Genome Assembly Algoritmi Sequenze
     
 

Verona

Rosalba Giugno

 
Interessi Metodologie Applicazioni
Analisi algoritmica di dinamiche biologiche Algoritmi
Sistemi
Popolazioni
Reti
Analisi informazionale di genomi Algoritmi
Infrastrutture
Sequenze
Algoritmi di base per la bioinformatica Algoritmi Sequenze
Predizione
 

 

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